С 1846 г. служил военным врачом и главным хирургом на Кавказе. В процессе перемещения с войсками активно собирал гербарий.

После вернулся уже с семьей в Житомир губернским врачом, был помощником инспектора медицинской управы. Собранный обширный гербарий привел в порядок, наладив общение с Траутфеттером. На 1863 год у него уже был собран и гербарий окрестностей Житомира.

В момент польского восстания за оказание помощи раненным из отряда восставших, Лаговского арестовали и осудили на ссылку в Сибирь, куда отправился вместе с семьей. Весной 1865 добрался до Усолья. Там активно практиковал как врач и собирал гербарные коллекции. В 1867 перебрался в Иркутск. Несмотря на обширную практику, находил время и на ботанические экскурсии. Посещал с этой целью окрестности Иркутска, долины рек Иркута, Кая, Ушаковку и др., Лиственничное и Култук, Хамар-Дабан - всего 107 пунктов в Прибайкалье.

Кавказский гербарий Лаговского перешел Траутфеттеру - и частично остался в коллекциях Киевского университета, частично в Гербарий Ботанического сада Петербурга.

Прибайкальский гербарий был выкуплен в 1893 г. и хранился в Львовском университете (наверное, до сих пор хранится), включал около 1500 видов.

По воспоминаниям Б. Дыбовского, доктора Лаговского, уже тяжело больного, он видел последний раз в 1872 г. - заходил к нему проститься перед своей поездкой в Даурию.