Сын известного альголога, профессора Федора Карловича Мертенса (Mertens, Franz Karl) (1764—1831 гг.) - не путать!

Андрей Карлович окончил университет в Галле. В 1821-1823 гг. работал в Бремене. В 1823 г. прибыл в Россию. В 1826-1829 гг. в качестве врача и натуралиста Мертенс совершил кругосветное плавание на шлюпе «Сенявине» под руководством Ф.П. Литке. Собрал большие коллекции семян и растений с Камчатки и Охотского побережья, а также коллекции морских беспозвоночных животных.

Собранные им коллекции растений обработаны были частью им самим, частью его отцом, а также Г.П. Бонгардом, А.Ф. Постельсом, К.А. Триниусом.

Мертенс был одним из создателей новой науки — этноботаники, науки, которая позволяла объяснить, каким образом человек изменял и приспосабливал к своим нуждам растительный мир океанийских островов. В 1830 г. принял участие в учебном плавании к берегам Исландии в составе трех судов «Анна», «Принц Оранский» и бриг «Алякс» под руководством Ф.П. Литке. Плавание оказалось неудачным, кроме того, на «Принце Оранском» случилась вспышка тифа. Пренебрегая своей безопасностью, мужественный доктор заразился и после двухнедельных тяжелых страданий скончался.

Умер в Петербурге. В короткой надгробной речи Ф.П. Литке произнес над прахом своего верного друга: «…Какая прискорбная, большая потеря, незаменимая не только для меня и всех друзей усопшего, но и для всей русской науки».

В честь А.К. и Ф.К. Мертенса названы: мыс в Беринговом море и пик в Каролинском архипелаге, а также несколько видов растений и животных.