На территории заказника преобладают подтаёжные бореальные и водно-ледниковые ландшафты с эоловыми и комовыми грядами, а также озёрами (Белое, Зацково, Молочное и др.). Рельеф равнинный, плосковолнистый, с островками комовых холмов, впадинами и котловинами озёр. Почвы дерново-подзолистые. Коренные леса — сосновые, производные — мелколиственные.